CD Skripsi

Analisis Multilokus Barkode DNA Pada Famili Cucurbitaceae

---

Famili Cucurbitaceae merupakan famili yang sangat beragam dalam tumbuhan berbiji tertutup dan sering dijadikan obat tradisional karena menghasilkan metabolit sekunder berupa Cucurbitacin B, D, E, dan I. Identifikasi dan penentuan hubungan kekerabatan antar spesies dalam famili Cucurbitaceae menggunakan lokus barkode DNA tunggal sampai saat ini masih kurang efisien. Tujuan dari penelitian ini ialah untuk menganalisis kombinasi multilokus barkode DNA yang tepat dan efektif untuk identifikasi spesies dari famili Cucurbitaceae. Bahan yang digunakan dalam penelitian ini adalah database sekuens matK, rbcL, ITS dan trnL-F IGS dari Famili Cucurbitaceae dan outgroup yaitu Tetrameles nudiflora yang dieksplor dari Genbank melalui website NCBI, dan kemudian dilakukan MSA (Multiple Sequence Alignment) menggunakan perangkat lunak MAFFT v.7. dan pengeditan sekuens menggunakan Bioedit v.7.2. lalu dilakukan analisis sekuens DNA dan konstruksi pohon filogenetik menggunakan MEGA 11. Hasil penelitian menunjukkan bahwa lokus ITS adalah barkode yang paling efisien untuk mengidentifikasi dan membedakan spesies dalam famili Cucurbitaceae. Kombinasi multilokus dari lokus ITS, matk, dan trnL-trnF IGS juga berpotensi untuk mengidentifikasi dan membedakan spesies dalam famili Cucurbitaceae dengan syarat yaitu ITS harus diikutsertakan (menjadi lokus utama) dan tidak mengikutsertakan rbcL karena variabilitasnya yang rendah.

Kata Kunci: Cucurbitaceae, matK, rbcL, ITS, trnL-F IGS

---

状況

Detail Information

シリースタイトル

-

請求記号

2103113254

公開者

Pekanbaru : Universitas Riau FMIPA Biologi., 2025

校合

-

言語

Indonesia

ISBN/ISSN

-

分類

2103113254

Content Type

-

Media Type

-

Carrier Type

-

刊行

-

キーワード

BIOLOGI

形態

-

Statement of Responsibility

Mutia

Other version/related

添付ファイル

Comments

---

You must be logged in to post a comment